新一代的玻片结构实现了单细胞水平的分辨率

Visium HD 空间基因表达玻片包含两个6.5x6.5mm的捕获区,其中含有约1100万个2x2um带有条形码的方格,它们无间隙地排列成寡核苷酸连续区块，实现单细胞水平的空间分辨率。数据能够以2um以及多种拼接尺寸输出。建议以8x8um拼接作为起点进行可视化和分析。

 

实现各种FFPE样本的空间分析

Visium HD与含有mRNA的人类和小鼠福尔马林固定石蜡包埋 (FFPE) 组织切片兼容。这包括存档的FFPE蜡块和载玻片上的预先切片的组织。

将组织学提升到一个新的水平

Visium HD空间基因表达与用于形态学分析的苏木精和伊红 (HE) 染色以及用于蛋白质共检测的免疫荧光 (IF) 染色兼容。可利用来自同一组织切片的高分辨率空间转录组学数据来提升对HE和IF成像样本的分析。

Visium HD玻片：新一代的玻片结构，实现单细胞分辨率

Visium HD空间基因表达玻片包含两个6.5 x 6.5 mm捕获区域，其中寡核苷酸连续排列在数百万个无间隙的2 x 2 µm条形码标记的正方形中，实现单细胞级的空间分辨率。数据以2 µm正方形单位以及多个合并的分析单位输出。8 x 8 µm大小的分析单位是推荐的可视化和分析的起始点。

Visium CytAssist：通过简单的工作流程获得无与伦比的空间数据质量

(1) 遵循标准的组织学操作流程，直接在载玻片上对组织进行切片、染色和成像

(2)预筛选以找到最具生物学意义的组织切片

(3)无需优化即可探索各种各样的FFPE组织

 

数据分析：易于使用的可视化工具将组织学和基因表达数据无缝结合

10x Genomics提供两种类型的软件来帮助您分析数据：Space Ranger和Loupe Browser。Space Ranger是一款分析软件，可自动将空间基因表达信息叠加在组织图像上，并识别具有相似转录特征的条形码标记的方块簇。然后，您可以使用Loupe Browser（一种可视化软件）以交互方式探索结果。您可以从10x Genomics支持网站免费下载Space Ranger和Loupe Browser。

探索组织背景中的基因表达簇

 

将数千个基因的表达映射到显微镜成像的H&E或IF图像上

如果您有空间转录组需求，欢迎您联系我们！